Mongabay bermula sebagai layanan berita berbahasa Inggris pada 1999, tetapi kemudian mengembangkan model operasionalnya di Indonesia. Setelah mengidentifikasi titik kritis dalam pengelolaan sumber daya alam Indonesia, Mongabay meluncurkan situs berbahasa Indonesia pada pertengahan 2012. Saat diluncurkan, Mongabay Indonesia mengisi kekosongan penting di pasar media yang pada umumnya minim berita lingkungan, dan berhasil menarik perhatian sejumlah pejabat tinggi Indonesia, termasuk pimpinan kementerian utama.
